Yamashiro Keigo, popüler bir manga sanatçısı olmak ister. Çizime doğal bir yeteneği vardır ancak iyi kişiliği nedeniyle kötü karakterler yaratamaz. Bu yüzden de bir manga sanatçısına asistanlık yapmaktan öteye geçemez. Manga sanatçısının isteği üzerine, mutlu bir ailenin eskizini çizmek için bir eve gider. Ancak orada dört ceset ve yabancı bir adamla karşılaşır. Keigo, polise hiçbir şey bilmediğine dair yalan söyler ve gördüğü adamı, “34” adlı mangasının kötü karakteri olarak çizmeye karar verir. Manga yayınlandığında, büyük başarıya ulaşır ve Keigo’nun hayali gerçek olur. Fakat o sırada, mangasında çizdiklerine çok benzer cinayetler gerçek hayatta gerçekleşmeye başlar. Katil, Keigo’nun karşısına çıkar…
Makino Tsukushi, Eitoku Gakuen lisesine giden tek fakir öğrencidir. Okul 4 zengin ailelerin çocuklarından oluşan ve F4 (Flower 4) adı verilen 4 çocuk tarafından yönetilmektedir. Aileleri okula destek sağladığından bu çocuklara okulda kimse karışamaz, istediklerini yapabilirler ve eğer sinirini bozan öğrenciler olursa onlara kırmızı not göndererek okul hayatlarını zulme çevirebilirler. Bu 4 çocuk Domyouji Tsukasa, Hanazawa Rui, Nishikado Sojiro ve Mimasaka Akira’dır. Tsukushi’nin tek isteği göze çarpmadan sakince okulunu bitirebilmektir. Ama bir gün arkadaşına bir kaza sonucu Domyouji sataşınca onu savunmak zorunda kalır. Ardından F4’den kırmızı not alan Tsukushi için okul hayatı zor hale gelmeye başlayacaktır. Ta ki F4’ün lideri Domyouji ondan etkilenip aşık olana kadar… Hana Yori Dango dizisinin finalidir.