Özet;

Burası bildiğiniz dünyalardan değil. Burada simsiyah saçları, kapkara giysileri ve çarpıcı ve parlak mavi gözleri olan bir kız gezinmekte. İsmi Black Rock Shooter. Dev silahıyla, kendini azılı bir savaşın ortasına atar…
Bu sırada başka bir dünyada, Mato Kuroi, değişik bir soyadı olan sınıf arkadaşı Yomi Takanashi’yle ilgilenmeye başlar. Fazla dışa dönük olmayan Yomi’yle konuşmak için elinden geleni yapar. Yu Koutari, en yakın arkadaşı Mato’nun bu çabalarıyla alay eder ama bir yandan da ona destek olur. Bunlarla birlikte Mato, okulda kendini renkli kişilerle çevrilmiş olarak bulur: Eksantrik okul danışmanı Saya Irino ve kanı kaynayan kulüp başkanı Arata Kohata gibi.
Bir gün, fırsatlar kendini gösterir. Mato, en sevdiği kitap “Küçük Kuş ve Değişik Renkler”in Yomi’de de olduğunu öğrenince aralarında bir sohbet geçer ve Yomi onu evine davet eder. Her şey gayet iyi gitmektedir, ta ki tekerlekli sandalyeli bir kız belirinceye kadar. Bu kişi, Yomi’nin en yakın arkadaşı Kagari Izuriha’dır…
İki dünya. Mato ve Black Rock Shooter. Bu, “acılarının” bir hikâyesidir.
Vocaloid yapımlarının sevilen yüzü Hatsune Miku’nun, Huke adlı bir sanatçı tarafından yapılan Black★Rock Shooter adlı bir illüstrasyonunu, çok tutan bir MAD videosu takip etmiş ve ardından Good Simle Company piyasaya daha çıkmadan popüler hale gelen bir figürünü duyurumuştu. Bir süre sonra yapımın pilot bölümü 30 Eylül’de piyasaya çıkacak olan bir animesi duyuruldu. Pilot bölümü başka anime yapımlarının takip etmesi planlanıyor.